就目前而言， 我國(guó)的畜牧養(yǎng)殖業(yè)正處于逐漸規(guī)范期，入行門檻相對(duì)較低，技術(shù)水平參差不齊，養(yǎng)殖布局比較混亂，畜禽產(chǎn)品流通環(huán)節(jié)、消毒控制尚有一定疏漏。 在這種狀況下， 老病不去新病又來， 疾病種類逐漸增多，感染源密布，防不勝防，疫病此起彼伏。受多元病原干擾和動(dòng)物健康欠佳的影響，疫苗預(yù)期免疫效果很難達(dá)到。
疫苗的研制、生產(chǎn)、應(yīng)用其目的是用來讓機(jī)體產(chǎn)生特異性抗體對(duì)抗某種疾病危害。 可疫苗本身也存在諸多問題影響著動(dòng)物健康和免疫效果。例如，細(xì)胞苗在生產(chǎn)過程中如果沒有達(dá)到高度純化， 疫苗內(nèi)存就可能存在大量異源蛋白（細(xì)胞碎片），而這種異源蛋白對(duì)動(dòng)物機(jī)體來說就是異物，極易造成機(jī)體過敏等應(yīng)激反應(yīng)。
當(dāng)然更加糟糕的是如果存在其他熱源性物質(zhì)即非需要特定微生物時(shí)，疫苗接種即有過敏、發(fā)熱現(xiàn)象發(fā)生； 滅活疫苗更是存在佐劑和滅活工藝問題，大量低質(zhì)佐劑與滅活用的高濃度甲醛不僅直接影響疫苗質(zhì)量，更要命的是這些低質(zhì)佐劑在注射時(shí)常堵塞注射針頭并和殘留甲醛同時(shí)對(duì)機(jī)體造成極大激刺，且不能被機(jī)體吸收，易在注射部位形成干酪、壞死；另外在疫苗生產(chǎn)上管理不夠細(xì)致、完善，或沒有足夠先進(jìn)的技術(shù)手段，在生產(chǎn)一種疫苗的同時(shí)被另一種病毒污染，如豬瘟疫苗常被牛黏膜病毒污染， 雞痘疫苗常被網(wǎng)狀內(nèi)皮增生病毒污染等， 這樣疫苗防疫的同時(shí)人工接種了另外一種病毒，可能給接種動(dòng)物的健康帶來感染疫病的風(fēng)險(xiǎn)。
疫苗的研制生產(chǎn)往往落后于病毒的變異，當(dāng)病毒發(fā)生變異后，如還繼續(xù)用原來的疫苗免疫勢(shì)必不能取得預(yù)期的防控效果；另外疫苗抗原滴度的高低也影響著動(dòng)物預(yù)防接種的免疫效果， 目前有些疫苗其單位疫苗抗原量不能達(dá)到足夠高的含量， 不能達(dá)到預(yù)期的抗體滴度， 不能達(dá)到有效的免疫保護(hù)。一些凍干細(xì)胞活疫苗對(duì)其運(yùn)輸、保存條件要求均非?？量?， 常常難以達(dá)到要求， 致使疫苗在使用前已經(jīng)失效或效價(jià)降低；疫苗的使用需要嚴(yán)格規(guī)范的操作方法，否則同樣難以達(dá)到預(yù)期的免疫效果。
